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          上海miRNA測序實驗

          產品介紹

          上海miRNA測序實驗

          miRNA 測序是研究特定組織在特定狀態下的已知miRNA,分析預測新的miRNA,并對已知 miRNA 和新miRNA進行靶基因預測。通過對miRNA靶基因注釋及代謝通路分析,將鑒定出的 miRNA與相應表型差異關聯起來,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力的工具。

          上海miRNA測序實驗生物信息分析內容

          1、數據產出統計和質量評估

          2、sRNA在參考基因組上的分布

          3、sRNA分類注釋統計

          4、堿基偏好性分析

          5、基因表達水平分析

          6、新轉錄本預測

          7、差異miRNA靶基因預測

          8、差異基因篩選及聚類分析

          9、差異表達miRNA靶基因GO富集分析

          10、差異表達miRNA靶基因Pathway富集分析

          11、差異表達miRNA靶基因蛋白互作網絡分析

           

          技術參數

          樣本類型:total RNA

          樣本要求:總量≥3 μg,濃度≥200 ng/μL

          文庫類型:Small RNA文庫

          測序策略:HiSeq SE50,推薦數據量:≥10M reads

          項目周期:35個工作日

           

          結果示例

          樣本已知miRNA各位置堿基偏好性

           

          新miRNA二級結構及reads mapping示意圖

           

          各個樣本之間共有novel miRNA分布

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          上一產品:上海細胞劃痕實驗.

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