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          上海生物信息學分析實驗

          產品介紹

          隨著生命科學和計算機科學的飛速發展,生物信息學作為兩者相結合的一門新學科,已廣泛應用于生命科學的多個領域,成為解決科學問題的一個重要工具??蒲泄ぷ髡邆兙哂袑I的背景,然而如何運用生物信息學服務解決科學問題,是大家都面臨的問題。豐核信息為廣大科研工作者提供專業的生物信息服務,與您一起解決科學問題。

          一、上海生物信息學分析實驗服務介紹

             近幾年,實驗數據不斷積累并存儲在公用數據庫中,可供廣大科研工作者下載使用。因此,對這些數據進行整理,并進一步深度挖掘,已成為一個重要研究方法。

          二、上海生物信息學分析實驗服務流程

          1、客戶提供研究方向

          2、生信工程師提供分析提綱

          3、反饋溝通

          4、進行數據分析

          5、出具分析報告

          三、上海生物信息學分析實驗研究案例展示(芯片分析)

          研究背景

          肝癌可以分為三種類型:肝細胞癌、膽管細胞性肝癌和混合性肝癌。本研究的目的是為了尋找這三種肝癌基因表達情況的不同點和相同點。

          研究策略

          1 從NCBI GEO數據庫中下載轉錄表達譜,包括70張肝細胞癌芯片,13張膽管細胞性肝癌芯片和7張混合性肝癌芯片。

          2 對三種類型的肝癌進行兩兩比較,尋找差異基因。

          3 蛋白互作網絡構建,聚類分析,MCODE分析,GSEA富集分析

                                                                                                                                                           

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